云南醫藥工業股份有限公司前身為“云南省醫藥醫療器械工業公司”，成立于1980年1月1日，是以原“云南省化學工業局”下屬“醫藥處”為基礎組建的負責全省醫藥工業行業管理工作的行政性公司；成立之初，公司在云南省醫藥管理局的領導下，主要工作為管理、協調全省醫藥生產企業的生產和發展，并負責采購供應全省各制藥廠生產所需的生產原料和制藥設備。
在全國改革開放的浪潮中，公司在1980年至1999年二十年的發展歷程，由單一的“原料經營部”一個經營部門，逐步發展成立了“藥品采購供應站”、“新特藥分公司”、“銷售分公司”、“醫療器械經營部”、“福生醫藥連鎖分公司”、“地產銷售分公司”等經營業務部門，并于1997年7月以承擔債權債務方式兼并“昆明振華制藥廠”，投資參股了“昆明積大制藥有限公司”；工業公司由一個行政管理機關逐步發展成為擁有7個經營部門、1個直屬制藥廠、1個參股制藥廠，年經營規模3億元的大中型綜合性醫藥企業，公司資產由成立之初上級撥付的40萬元籌辦資金發展到改制前的2721余萬元，國有資產增值68倍。
公司改制前企業基本情況
企業性質：國有企業；
注冊資本：1086萬元；
注冊地址：云南省昆明市棕樹營中心組團21幢。
經營范圍：批發、零售、采購供應醫藥系統內所需的物資；醫用原料、制藥設備、醫療器械、中西藥品。
1999年股份制改造前公司年經營規模約為3.5億元，年實現利潤760萬元。
1999年，為壯大公司發展實力，增強企業市場競爭力，建立現代企業制度，經云南醫藥集團有限公司（上級主管單位）、云南省經濟體制改革委員會、云南省經濟貿易委員會等有關單位批復同意(云藥集團司經發[1998]第76號文件、云經貿企－[1999]494號文件等)，改制為股份制有限公司。
公司改制后企業基本情況
公司全稱：云南醫藥工業股份有限公司；
注冊資本：8192.68萬元；
注冊地址：云南省昆明市棕樹營中心組團21幢。
經營范圍：批發、零售、采購供應醫藥系統內所需的物資；醫用原料、制藥設備、醫療器械、中西藥品等。
股本結構：云南醫藥集團有限公司 33.22%；
云南南天電子信息股份有限公司 33.22%；
云南省醫藥醫療器械工業公司職工持股會 24.41%；
珠海南方集團有限公司 4.88%；
珠海南方投資有限公司 4.27%。
改制后，股份公司通過資產重組邁出了發展的新步伐，以資產投入方式參股高新技術企業——中外合資昆明積大制藥有限公司，通過投資使股份公司的資本實現了有效運作，既增強了整體實力，有利于建立更高效率的科研及生產銷售體系；又達成了更好的協同效益、規模效益，為股份公司創造了豐厚的利潤回報，也為股份公司的長期發展打下良好的基礎。
2001年，股份公司在昆明高新技術開發區購地42畝，其中一期投資3000萬元建設研發、生產基地及物流設施。這些舉措是圍繞公司發展戰略，為完善科、工、貿一體化建設，以求更大的發展所進行的必要準備。
改制后，股份公司大力加強了對所屬制藥工業的技術改造力度，對公司下屬企業昆明振華制藥廠前后共投入數千萬元用于技術改造及產品研發，昆明振華制藥廠通過技改從一個技術與產品均相當落后的老廠變成了一個已獲得了6個劑型國家GMP認證、172個藥品批文的的現代制藥企業。同時，公司各主要經濟技術指標連年遞增，疊創新高。主營業務收入由1999年的3.5億元到2010年的10億元；營業利潤由1999年760萬元到2010年的4000萬元，銷售、利潤均實現大幅增長。
2009年7月，公司在股東的大力支持下，斥資1.2億元成功收購“云南植物藥業有限公司”，進一步增強了股份公司做大做強云南生物醫藥產業的實力。
2011年工投集團增資控股后情況
2011年11月，股東“云工投集團”注資近2億元，成功對公司實施增資擴股，并成為公司控股股東。此次增資擴股，為股份公司的再一次騰飛注入了新的活力，并為將在“十二五規劃”中把公司打造成云南省又一大型醫藥企業集團奠定了堅實的基礎。
公司全稱：云南醫藥工業股份有限公司；
注冊資本：13192.68萬元；
注冊地址：昆明市高新區科發路468號。
經營范圍：中藥材、中成藥、中藥飲片、化學原料、化學藥制劑、抗生素、生化藥品、生物制品（含疫苗）、蛋白同化制劑濟和肽類激素、麻醉藥品、精神藥品（一類精神藥品制劑，二類精神藥品原料藥、制劑）、毒性藥品、戒毒用美沙酮口服液、醫療器械（一、二、三）類、保健食品、預包裝食品，消毒產品、化妝品，日用百貨的銷售；貨物進出口及技術的出口業務；倉儲服務、裝卸搬運、普通貨運、物流方案設計、多式聯運服務；房屋租賃。
目前公司的股東構成及股權比例
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股 東 |
持股比例 |
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云南省工業投資控股集團有限責任公司 |
58.53% |
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云南南天電子信息產業股份有限公司 |
41.36% |
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云南南天電子信息產業股份有限公司職工技協服務部 |
0.11% |
云南醫藥工業股份有限公司股權結構圖：
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